Desa Barataku pada awalnya adalah  wilayah yang berada di pesisir pantai, yang orang – orangnya atau penduduknya berasal dari desa Bakun dan Buo yang mata pencahariannya sebagai nelayan. Pada perkembangannya wilayah tersebut bertambah penduduknya dan membentuk sebuah desa dengan nama Desa Barataku untuk membedakannya dengan desa induk yaitu desa Bakun. Setelah beberapa waktu berlalu, terjadi abrasi yang sangat membahayakan kelangsungan hidup masyarakat Barataku yang mengharuskan mereka untuk mencari tempat tinggal yang baru. Dipilihlah suatu tempat yang bernama “Barataku” sebagai tempat tinggal yang baru untuk sebagian masyarakat Barataku, sebagian masyarakat lainnya memilih tempat tinggal di Desa Bakun dan Buo. 

Berikut ini nama – nama Kepala Desa yang pernah memimpin Desa Barataku:

1. Dibo Simuda ( 1941 – 1952 )
2. Kristian Doteua ( 1957 – 1959 )
3. Korneles Tukang ( 1959 – 1967 )
4. Josias Tuandali ( 1967 – 1975 )
5. Agus Dotinagi  ( 1972 – 1977)
6. Robinson Lalomo ( 1977 – 1990 )
7. Obet Taliawo ( 1990 – 2003 )
8. Pjs Kepala Desa Marten Tuandali ( 2002 – 2006 )
9. Agustinus Kurama ( 2006 – 2012 )
10. Pjs Kepala Desa Hopni Tuandali ( 2012 – 2014 )
11. Parson Masanae (2014 – 2019 )
12. Pjs Kepala Desa Johan Nyihatiti ( 2020)
13. Pjs Kepala Desa Hopni Tuandali ( 2021)
14. Parson Masanae ( 2021-sampe sekarang)